В 1994 году кафедра факультетской терапии начала самостоятельную работу в Ургенчском филиале 1-го Ташкентского государственного медицинского института. Первым заведующим стал доктор медицинских наук, профессор Равшанбек Давлетович Курбанов. В первоначальном составе работали Р.Б. Абдуллаев, Ж.А. Гапуров, А.Ш. Юсупов, К.А. Ибрагимов, А.Д. Атаджанова, Ш.А. Ходжаев, Ф.Х. Худайкулова и К.Р. Рузметов.
В 1995–2012 годах кафедрой руководил профессор Равшанбек Бабажонович Абдуллаев, в 2012–2015 годах — доктор медицинских наук Дилфуза Сабуровна Маткаримова, в 2015–2017 годах — вновь профессор Р.Б. Абдуллаев. В последующий период кафедру возглавляла Азада Батировна Якубова.
В сентябре 2022 года кафедра получила название «Внутренние болезни, реабилитология и народная медицина». С 2025 года она носит название «Внутренние болезни, нефрология, гемодиализ и реабилитология». В 2026 году профессор Равшанбек Бабажонович Абдуллаев вновь назначен заведующим.
В альманахе кафедры отмечается, что за время её работы подготовлено более 150 клинических ординаторов и более 20 магистров. Выпускники работают в практическом здравоохранении и медицинском образовании.